Trascriptomics with RNA sequencing

RNAseq concepts & Analyses

Corso intensivo sui fondamenti delle procedure, strumenti e problematiche relativi all'analisi del trascrittoma mediante sequenziamento (RNA sequencing).

Formato del corso online.

Webinar introduttivo serale (1h) – generalmente il lunedì sera – seguita da una Settimana di autoriscaldamento.
Prima sessione online LIVE (ca 6h) il sabato successivo al webinar (orario indicativo 10:00 – 16:30).
Seconda sessione online LIVE (ca 6h) il secondo sabato successivo al webinar (orario indicativo 10:00 – 16:30)..

Data mobile secondo richieste: il corso viene attivato al raggiungimento del minimo di partecipanti (5) e la data viene concordata assieme ai partecipanti. Se sei interessato/a e vuoi partecipare manifesta il tuo interesse scrivendo a info@infobiology.com oppure segui il link di pagamento più sotto e procedi alla prenotazione (non avviene alcun pagamento fino alla conferma del corso!)

Descrizione

Rivolto a ricercatori, biologi, tecnici e professionisti biomedici che vogliono avere una visione completa, pratica e aggiornata in tema di RNAseq.

Se pur non serve essere programmatori in R, una minima familiarità con l’ambiente R e RStudio nonchè i concetti base di gestione dei pacchetti R è utile alla comprensione completa del corso. La settimana di preriscaldamente sarà mirata a colmare eventuali gaps; chi fosse completamente a digiuno può considerare il nostro corso Intro2R. Sono inoltre necessari una postazione computer aggiornata, una connessione internet stabile e l’accesso (gratuito) alla piattaforma di comunicazione Zoom.

Costo del corso: 399,00 euro (IVA inclusa)

Prenotazione/acquisto

Clicca qui per avviare il processo di prenotazione: successivamente, e solo al raggiungimento del numero minimo di richieste, verrai contattato per concordare la data e con i dettagli per il pagamento (via bonifico bancario).

Hai bisogno di informazioni dal vivo?

In ogni momento siamo disponibili “live” su appuntamento (call remote gestite da Whereby.com o Zoom) per parlare con voi e chiarire eventuali dubbi sul contenuto del corso. Scriveteci per concordare un appuntamento, vi risponderemo proponendovi alcune date tra cui scegliere. 

Descrizione

Il corso è un misto di teoria (descrizione e concetti strategici) ed esempi pratici di analisi di RNAseq. Dalla genesi dei dati grezzi alla preparazione dei dati per l’interrogazione biologica e di espressione differenziale.

Il corso mira a far acquisire una conoscenza dei diversi metodi disponibili e del loro utilizzo in funzione della domanda scientifica, più che a rendervi autonomi nell’analisi del dato, cosa che richiederebbe più tempo. Gli obiettivi del corso sono conoscere la forma dei dati di RNAseq, il formato dei file e i principali modi di manipolarli e di controllarne la qualità; capire le metriche di espressione genica quantitativa; apprendere le problematiche relative all’infrastruttura informatica necessaria per eseguire l’analisi; avere una conoscenza dell’intero percorso analitico dal dato grezzo al dato interpretato.

  • Apprendere le basi teoriche del sequenziamento applicate all’RNA.
  • Conoscere le diverse pipelines di analisi e dei relativi software che le compongono.
  • Capire i formati di files e le metriche principali della gene expression.
  • Acquisire l’arsenale concettuale utile alla comprensione e all’interazione con bioinformatici.

Alla fine del corso verrà rilasciato ai partecipanti l’attestato di partecipazione, l’intero materiale didattico e una serie di consigli per come eventualmente proseguire in funzione delle proprie necessità (diventare autonomi nell’analisi o meglio interfacciarsi con i bioinformatici).

Dove
Online, da casa propria. Necessaria connessione internet stabile e un personal computer recente e aggiornato.

Lingua
Italiano, materiale in inglese

Durata
webinar introduttivo di 1 ora
+ preparazione autonoma online (max 4 ore durante settimana successiva al webinar)
+ corso intensivo di 12 ore suddivise su 2 sabati consecutivi

Un corso Revelo-Infobiology