Single cell RNAseq con R e Seurat
Questo corso approfondisce i protocolli autonomi per l’analisi dei risultati di single-cell RNA sequencing con particolare riferimento ai dati prodotti da macchine 10X Genomics e BD Rhapsody, e secondo un diffuso e consolidato workflow di analisi in R.
Teoria
40%
Pratica / Coding
60%
Viene affrontato il protocollo standard di espressione differenziale per cluster di cellule con R/Seurat e le strategie di integrazione multiomica e di reference-based annotation con Azimuth, nonchè di ottimizzazione delle gene signatures con combiroc.